《避难方舟》漫画讲述年前，出现了一种奇怪的机器人，人们称之为【蜘蛛】，它们会攻击进入自己视野的任何生物。因为蜘蛛的出现，人们在避难所周边布置了防护墙，各个城市也因此划分成了：防护墙内侧——人们居住的避难所【方舟】；防护墙外围——遭受蜘蛛侵蚀的【被遗弃的城市】；以及人们无法掌握确切情况的蜘蛛领地——【死之地】。 而故事，也由此展开……
